主要以小魔仙美琪美雪的校园和成长经历展开故事，该剧主要有两条主线，一条是魔仙小蓝奉命找回魔仙彩石，一条是实习小魔仙美琪美雪经过考核转为正式小魔仙，巴啦啦小魔仙第一部的剧情是巴啦啦系列中最耐看，最紧凑，最经典，同时也是最有教育意义的；
如严莉莉和美琪美雪之间，严莉莉的父母工作忙，总是没时间陪她，而且她妈妈总是看中她的学习成绩，这导致了严莉莉的嫉妒心和好胜心强，她总是以美琪美雪为敌，以至于让黑魔仙小月给利用了，但到最后她们三人还能成为朋友，实为不易；小蓝和美琪美雪之间的友情，小蓝虽然是美琪美雪家的保姆，但是美琪美雪把她当作知心朋友看待，在小蓝中了魔蝎草的毒之后昏迷不醒，美琪美雪更以真诚的眼泪开启魔仙彩石的能量，帮助小蓝苏醒过来；小月和小蓝之间，她们俩本是一对好朋友，但是在选守护魔仙的时候，魔仙女王选了小蓝没选小月，小月心生嫉妒走上了黑魔仙的道路，按理来说小月的魔法比小蓝出色很多，但是小月没有小蓝的一样东西，就是善良而且宽容的心......
而且第一部实打实的武打戏也很精彩，角色各方面的设定和角色戏份分配也很到位，该剧描绘魔仙堡的故事，很具有想象空间，故事设置在大人看来也是正能量和善良的代表，打动小朋友，也牵动着大人的心。
